Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5730507C01RikJ3QPX0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms