Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top6blJ3QMY9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Top6blJ3QMY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top6blJ3QMY9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms