Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc179J3QM76 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc179J3QM76 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc179J3QM76 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc179J3QM76 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc179J3QM76 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc179J3QM76 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1366.8 ms