Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17ldG5E8G2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17ldG5E8G2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17ldG5E8G2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17ldG5E8G2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17ldG5E8G2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17ldG5E8G2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp17ldG5E8G2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17ldG5E8G2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17ldG5E8G2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms