Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-1G3UXB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nkx1-1G3UXB3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx1-1G3UXB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-1G3UXB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms