Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd7E9Q9W7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd7E9Q9W7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms