Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc74aE9Q9U8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc74aE9Q9U8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms