Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdhr2E9Q7P9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdhr2E9Q7P9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdhr2E9Q7P9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms