Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230217C12RikE9Q3Z1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230217C12RikE9Q3Z1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms