Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup153E9Q3G8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup153E9Q3G8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nup153E9Q3G8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup153E9Q3G8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms