Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdzd2E9Q1M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd2E9Q1M1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms