Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Myo5cE9Q1F5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Myo5cE9Q1F5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Myo5cE9Q1F5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Myo5cE9Q1F5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.9 ms