Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9972E9Q053 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm9972E9Q053 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms