Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx60E9PZQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx60E9PZQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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