Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Scaf11E9PZM7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Scaf11E9PZM7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Scaf11E9PZM7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Scaf11E9PZM7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Scaf11E9PZM7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms