Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbf2E9PXF8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbf2E9PXF8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbf2E9PXF8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms