Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rsf1E9PWW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Rsf1E9PWW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Rsf1E9PWW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rsf1E9PWW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms