Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim5E9PV98 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim5E9PV98 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim5E9PV98 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms