Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp839E9PUU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp839E9PUU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp839E9PUU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp839E9PUU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms