Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clca3bE9PUL3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca3bE9PUL3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca3bE9PUL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca3bE9PUL3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms