Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
9330159F19RikD3Z623 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9330159F19RikD3Z623 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9330159F19RikD3Z623 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms