Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ldlrad1D3YYZ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldlrad1D3YYZ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms