Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500009C09RikD3YYW9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1500009C09RikD3YYW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1500009C09RikD3YYW9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms