Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lonrf1D3YY23 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lonrf1D3YY23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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