Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r180B9EK86 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r180B9EK86 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms