Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia4B8QI36 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia4B8QI36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia4B8QI36 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia4B8QI36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms