Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5483B2RV77 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5483B2RV77 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms