Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prrt4B2RU40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prrt4B2RU40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms