Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2012B1B0R1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm2012B1B0R1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2012B1B0R1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms