Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint6A7XUZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint6A7XUZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint6A7XUZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms