Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr16A3KMN5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr16A3KMN5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr16A3KMN5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr16A3KMN5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr16A3KMN5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr16A3KMN5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms