Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6880A3KG45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms