Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp8b5A3FIN4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8b5A3FIN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8b5A3FIN4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms