Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf39A2RT81 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf39A2RT81 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf39A2RT81 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms