Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms