Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn1aA2APX8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn1aA2APX8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn1aA2APX8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn1aA2APX8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms