Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn3A2ALK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ptpn3A2ALK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn3A2ALK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms