Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Frmpd1A2AKB4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Frmpd1A2AKB4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC38■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Frmpd1A2AKB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Frmpd1A2AKB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.7 ms