Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyb561d1A2AE42 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyb561d1A2AE42 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyb561d1A2AE42 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms