Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hivep3A2A884 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep3A2A884 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep3A2A884 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms