Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calcoco2A2A6M5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calcoco2A2A6M5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms