Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fam71e1A1L3C1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fam71e1A1L3C1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam71e1A1L3C1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms