Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trav12-2A0N8N6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trav12-2A0N8N6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trav12-2A0N8N6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms