Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930469K13RikA0A286YDB2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms