Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHF2

Vsig10l2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10l2A0A140LHF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vsig10l2A0A140LHF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsig10l2A0A140LHF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsig10l2A0A140LHF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms