Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28360A0A087WR25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28360A0A087WR25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28360A0A087WR25 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms