Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28919A0A087WP35 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28919A0A087WP35 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28919A0A087WP35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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