Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms