Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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