Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Tnnt3Q9QZ47 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnt3Q9QZ47 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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